主要讲述了赛尔号飞船在前往飞龙座星系途中意外误入逆世界空间，在逆世界中，由于精灵库迪拉克偷走位于三塔中乾坤戒指，导致一切万物都处于被逆转状态，同时也让赛尔号遭遇前所未有危机，为此星际探险员赛小息、阿铁打、卡璐璐踏上冒险征程，渐渐的三人发现这枚乾坤戒指竟关系谱尼、索伦森与库迪拉克种种恩怨....不过在三人努力下，乾坤戒指最终成功夺回，逆世界(克洛斯空间)也恢复正常，赛尔号得以离开逆世界继续朝飞龙座进发。当赛尔号抵达飞龙座后选择在龙眼星停靠休整，此时龙眼星上，霹雳龙哈维与霹雳龙贝娅正进行龙飞九天雨露仪式，他们要将祥云变为雨露来哺育大地与万物生灵。但在此期间，宇宙海盗迪恩掠走霹雳龙哈维用索伦森黑暗基因将其黑化，同时哈维与贝娅孩子小龙恩尼也不幸掉进危险天坑！由于缺少雨露滋润，龙眼星环境很快陷入恶化，危急时刻，赛小息三人深入天坑救出恩尼，最后凭借恩尼觉醒化解龙眼星环境危机，同时从神龙口中得知他们下一站是前方巨熊座。赛尔号也再次踏上征途。本季赛小息小队来到逆世界空间，探索龙眼星，遇到传说中的霹雳龙，更有神秘人物库迪拉克出现，尤尼卡和尤米娜在本季再次登场，索伦森与谱尼的故事继续展开，并解决危机。