本季主要讲述是2110年,地球能源接近枯竭,环境污染日趋严重,为解决地球能源危机,人类制造赛尔机器人,建造宇宙能源探索飞船赛尔号。宇宙探索任重而道远,肩负在宇宙中寻找无尽能源与新能源探索伟大使命,赛尔们向宇宙进发,但就在找到无尽能源时,无尽能源被宇宙海盗摧毁,赛尔们不得不去寻找藏在宇宙深处,由传说中圣灵系王者谱尼看守第二个无尽能源……而300年前,谱尼曾经在宇宙深渊救起过迷失宇宙海盗艾里逊,艾里逊最后为当四当家背叛谱尼,与迪恩带大批宇宙海盗设计圈套抓住谱尼,并将其封印300年……于是从那时起,谱尼无比憎恨机器人立志复仇。